Między 1939 i 1945 Höhn był dyrektorem Państwowego Instytutu Śledczego przy Uniwersytecie w Berlinie. W latach 1941–1943 publikował czasopismo poświęcone problematyce Lebensraumu oraz zyskaniu niemieckiej przestrzeni życiowej na wschodzie „Reichs-Volksordnung-Lebensraum”. Został wkrótce głównym specjalistą od spraw ludnościowych państw okupowanych. W 1944 awansowano go do stopnia SS-Oberführera.

Okres powojenny Po II wojnie światowej Reinhard Höhn ukrywał się, pracował jako uzdrowiciel, aby w 1955 pojawić się w roli założyciela, dyrektora oraz wykładowcy akademickiego w szkole zarządzania biznesowego Akademie für Führungskräfte der Wirtschaft (pol. Akademia Menedżerów Gospodarki) w Bad Harzburg w górach Harzu. Publikował również prace z zakresu teorii zarządzania, które miały wpływ na odbudowę i rozwój powojennej gospodarki RFN. Zadaniem uczelni było szkolenie młodej kadry kierowniczej, która miała objąć czołowe stanowiska w niemieckich przedsiębiorstwach. W sumie przez akademię przeszło około 600 000 studentów. Kiedy upubliczniono karierę Höhna w III Rzeszy, nastąpił upadek zarówno modelu jak i samej akademii, którą w 1989 przejęła grupa kształcenia ustawicznego COGNOS AG, a w 2005 uczelnię przeniesiono do Überlingen nad Jeziorem Bodeńskim.