Sezon 2013/2014 FIS Marathon Cup rozpoczął się 15 grudnia 2013 roku włoskim maratonem La Sgambeda, a zakończył 9 marca 2014 roku szwajcarskim Engadin Skimarathon.
Obrońcami tytułu byli Estonka Tatjana Mannima wśród kobiet, a wśród mężczyzn Włoch Sergio Bonaldi. W tym sezonie najlepsi okazali się Finka Riitta-Liisa Roponen oraz Niemiec Tom Reichelt.
Kalendarz i wyniki Mężczyźni LpDataZawodyDystans1. miejsce2. miejsce3. miejsce1.15 grudnia 2013 Livigno - La Sgambeda42 km s. dowolnym Petter Northug Petr Novák Alaksiej Iwanou219 stycznia 2014 Lienz - Dolomitenlauf42 km s. dowolnym Petr Novák Martin Koukal Martin Bajčičák3.26 stycznia 2014 Predazzo - Marcialonga70 km s. klasycznym Simen Østensen John Kristian Dahl Jørgen Aukland4.9 lutego 2014 Lamoura - Transjurassienne76 km s. dowolnym Mathias Wibault Benoît Chauvet Toni Livers5.16 lutego 2014 Otepää - Tartu Maraton63 km s. klasycznym Zawody odwołanoWyniki biegów FIS Marathon Cup 6.22 lutego 2014 Hayward - American Birkebeiner52 km s. dowolnym Tom Reichelt Simone Paredi Sergio Bonaldi7.1 marca 2014 Szklarska Poręba - Bieg Piastów50 km s. klasycznymZ powodu braku śniegu bieg na dystansie 50 km nie odbył się. Zawody odwołano8.9 marca 2014 Samedan - Engadin Skimarathon42 km s. dowolnym Anders Gløersen Jean-Marc Gaillard Toni Livers