Straż pożarna nie mogła przystąpić do akcji ze względu na obecność snajperów MNLF.
Walki w Zamboandze potępił filipiński rząd oraz Islamski Front Wyzwolenia Moro. 11 września 2013 walki koncentrowały się w dzielnicy Sta. Catalina. Armia rządowa przyjmowała pozycję defensywną, z kolei bojownicy Narodowego Frontu Wyzwolenia Moro atakowali za pomocą granatników. W południe tego dnia 13 tys. mieszkańców miasta, którzy ewakuowali się z powodu walk, zebrali się na miejscowym stadionie piłkarskim. 12 września 2013 walki wybuchły także w mieście Lamitan na wyspie Basilan. Z kolei w Zamboandze władze do walki z napastnikami zaangażowano czołgi. Spowodowało to spore zniszczenia w zabudowie miejskiej. 13 września 2013 walki trwały w trzech sektorach miasta: Rio Hondo, Sta. Barbara i Sta. Catalina. 14 września 2013 liczba zabitych osiągnęła 52 osoby, z czego 43 stanowili bojownicy MNLF. Z miasta ewakuowano również niemal 40 tys. cywilów. thumb|250px|Prezydent Benigno Aquino III podczas narady wojskowej 21 września 2013 Wczesnym popołudniem, 16 września 2013 ok. godziny 13. czasu lokalnego Filipińskie Siły Powietrzne za pomocą helikopterów MD-520MG dokonały ostrzału rakietowego terenów okupowanych przez islamistów.