W sezonie 2011/2012 po raz drugi z rzędu wygrał z ekipą z Dortmundu rozgrywki Bundesligi, a także sięgnął z nią po trofeum Pucharu Niemiec, pokonując w finale na Olympiastadion w Berlinie, 5:2 drużynę Bayernu Monachium. W sezonie 2012/13 wystąpił w 12 z 13 spotkań Ligi Mistrzów i był filarem drużyny, która dotarła do finału tych rozgrywek. W meczu finałowym, rozgrywanym 25 maja 2013, na Wembley, rozegrał 90 minut, lecz jego drużyna uległa w „niemieckim meczu” Bayernowi Monachium, 1:2. W 2014 wygrał z Borussią Superpuchar Niemiec. W Borussii Dortmund przez pewien czas występował także z dwoma innymi Polakami: Jakubem Błaszczykowskim (w latach 2010–2015) oraz z Robertem Lewandowskim (2010–2014), tworząc świetnie współpracujące na boisku, tzw. polskie trio z Dortmundu. W styczniu 2016 poinformowano o przedłużeniu kontraktu Piszczka z klubem do końca czerwca 2018. 4 lutego 2017 przeciwko drużynie RB Leipzig rozegrał swoje 250. oficjalne spotkanie w barwach Borussii Dortmund. 6 kwietnia 2017 przedłużył kontrakt z klubem do 30 czerwca 2019. 26 maja 2017, został wybrany do najlepszej jedenastki sezonu 2016/2017 w Bundeslidze. 27 maja 2017, po raz drugi w karierze, zdobył z Borussią Puchar Niemiec.