Puchar Świata kobiet w kolarstwie szosowym w sezonie 2006 to dziewiąta edycja tej imprezy. Organizowany przez UCI, obejmował dwanaście wyścigów, z czego dziewięć odbyło się w Europie, dwa w Australii i Oceanii oraz jeden w Ameryce Północnej. Pierwsze zawody odbyły się 26 lutego w australijskim Geelong, a ostatnie 10 września w niemieckiej Norymberdze. W tym sezonie wprowadzono klasyfikację punktową dla teamów.
Trofeum sprzed roku broniła Australijka Oenone Wood. W tym sezonie najlepsza w klasyfikacji generalnej okazała się Brytyjka Nicole Cooke (po raz drugi w karierze).
Wyniki DataWyścigPodium 26 lutego 2006 Australia World Cup Plik:Gold medal icon.svg Ina-Yoko Teutenberg Plik:Silver medal icon.svg Miho Oki Plik:Bronze medal icon.svg Katherine Bates 5 marca 2006 New Zealand World Cup Plik:Gold medal icon.svg Sarah Ulmer Plik:Silver medal icon.svg Oenone Wood Plik:Bronze medal icon.svg Ina-Yoko Teutenberg 18 marca 2006 Primavera Rosa zawody odwołane 2 kwietnia 2006 Ronde van Vlaanderen voor Vrouwen Plik:Gold medal icon.svg Mirjam Melchers Plik:Silver medal icon.svg Christiane Soeder Plik:Bronze medal icon.svg Loes Gunnewijk 19 kwietnia 2006 La Flèche Wallonne Féminine Plik:Gold medal icon.svg Nicole Cooke Plik:Silver medal icon.svg Judith Arndt Plik:Bronze medal icon.svg Trixi Worrack 23 kwietnia