W 1952 roku zmarł dziadek Johannesa książę Albert von Thurn und Taxis. W myśl postanowień testamentu stał się dziedzicem ogromnej fortuny, którą jego wuj Franz Joseph oraz jego ojciec Karl August mieli jedynie administrować. By podołać nowym obowiązkom, Johannes zdobył w Norymberdze zawód w zakresie bankowości. Od 1960 roku pracował w administracji. Zajmował się zarządzaniem dobrami rodzinnymi, między innymi poszerzając posiadłości w Ameryce Południowej. Współpracował najpierw z wujem Franzem Josephem, a po jego śmierci z ojcem Karlem AugustemMartin Dallmeier, Martha Schad, op. cit., s. 174..
Życie prywatne Johannes przez wiele lat był aktywnym bywalcem na wielu imprezach towarzyskich. Pisano o nim często i nie zawsze pochlebnie w gazetach. Mimo iż łączono jego osobę z wieloma kobietami, do 1980 roku książę pozostał kawaleremDer homosexuelle Mann.... W tymże roku Johannes poznał hrabinę Glorię von Schönburg-Glauchau. Dnia 30 maja 1980 roku odbył się ślub cywilny, a dzień później 31 maja ślub kościelny. Liturgię ślubną sprawował ówczesny biskup Ratyzbony Rudolf Graber (1903–1992). Para doczekała się trójki dzieci: Maria (ur. 1980), Elisabeth (ur. 1982), Albert (ur.