W wyniku modernizacji jego długość zwiększyła się z pierwotnych 28,1 metra do 32 metrów, wyporność wzrosła do 161 ton, a wyrzutnie torpedowe zastąpiono czterema wyrzutniami min o pojemności 8 minGardiner,.. Conway’s All the World Fighting Ships 1906-1921, s. 180..
Służba UB-16 rozpoczął służbę we Flotylli Flandria (U-boote des Marinekorps U-Flotille Flandern) 1 czerwca 1915 roku. Pierwszym dowódcą okrętu mianowano 12 maja 1915 roku Hansa ValentineraHans Valentiner (17 czerwca 1888 – 19 grudnia 1917), pierwszy dowódca UB-16, następnie dowódca UB-15, UC-37, UC-71 oraz U-56, na pokładzie którego zginął wraz z całą załogą. Pod jego dowództwem okręty te zatopiły 50 statków o łącznej wyporności BRT, oraz dwa uszkodziły ( BRT). - Uboat.net WWI U-boat commanders., który odniósł pierwsze zwycięstwa na opisywanej jednostce. 3 czerwca 1915 roku, podczas pierwszego patrolu po Morzu Północnym około 45 mil na południowy wschód od Lowestoft, UB-16 zatrzymał i zatopił poprzez podłożenie ładunków wybuchowych trzy brytyjskie łodzie rybackie: „Boy Horace", „Economy” oraz „E & C"Ships hit by UB 16 – Uboat.net, Ships hit during WWI [dostęp=2013-10-11].