Krzysztof Maciej Kowalski (ur. 12 grudnia 1951) – polski historyk, profesor nauk humanistycznych.
Studia historyczne na Uniwersytecie Gdańskim ukończył w 1975. Doktorat obronił w 1984, a habilitację w 1993. Tytuł naukowy profesora uzyskał w 2007.
Specjalizuje się w epigrafice, ikonologii historycznej, teorii i metodologii historii oraz historii kultury materialnej i kampanologii historycznej.
Pełni funkcję kierownika Zakładu Metodologii Historii, Historii Historiografii i Archiwistyki w Instytucie Historii Uniwersytetu Gdańskiego.
Książki Polskie źródła ikonograficzne XVII wieku : analiza metodologiczna (1988) Artefakty jako źródła poznania : studium z teorii nauki historycznej (1993) Księgozbiory parafialne archidiakonatu pomorskiego w XVI-XVIII w[ieku] : studium z dziejów kultury intelektualnej Prus Królewskich (1993) Artefakty jako źródła poznania : studium z teorii nauki historycznej, 2 wyd.rozszerzone (1996) Dawne inskrypcje pomorskie : studia epigraficzne (2001) Dzieje Gminy Stegna (współautorstwo z Barbarą Klassą) (2003) Inskrypcje na dzwonach gotyckich w Prusach : studium z epigrafiki kampanologicznej (2006) Tubae Dei : studia kampanologiczne (2006) Z dziejów krainy nad rzeką Łebą : studia i materiały historyczne (2008) Vocor Augustinus : zabytki dawnej kultury religijnej w Piasecznie (2012) Kościół