Witold Drabikowski zajmował się początkowo badaniem wiązania związków fosforowych z białkami. Jego pierwsza publikacja naukowa, wydana w 1954 r., była zatytułowana Wolny i związany ATP i ADP w mięśniach żaby. Wczesne zainteresowanie tkanką mięśniową odzwierciedla fakt napisania przez niego w 1956 r. książki pt. Jak pracują nasze mięśnie. W 1959 r. Witold Drabikowski uzyskał w Instytucie im. M. Nenckiego stopień doktora nauk przyrodniczych na podstawie rozprawy pt. „Badania nad połączeniami różnych białek z nukleotydami i ortofosforanem”. Promotorem był Włodzimierz Niemierko.
W 1960 Witold Drabikowski wyjechał na półtoraroczny staż podoktorski do Zakładu Biochemii w ,,Retina Foundation" w Bostonie, USA. Badał tam właściwości białka mięśniowego aktyny, w szczególności- reaktywność grup tiolowych i wiązanie nukleotydów fosforanowych.