Protosi są główną rasą, której historia zostanie przedstawiona w Legacy of the Void. Jim Raynor i Sara Kerrigan również są częścią tej opowieści, natomiast głównym antagonistą jest Amon, upadły xel'naga oraz twórca hybryd zergów i protosów. Dyrektor ds. rozwoju franczyzy Chris Metzen porównał tę historię do filmu 300, gdzie niewielka siła angażuje się w konflikt z wielką potęgą w ostatnim rozpaczliwym starciu. Ponadto trzeci epizod ostatecznie kończy fabułę rozpoczętą w StarCraft i kontynuowaną w StarCraft II, a "wszystkie główne postacie doczekały się satysfakcjonującej konkluzji". Jednakże ze względu na status samodzielnego dodatku historia została napisana w taki sposób, aby ci, którzy nie grali w poprzednie części niczego nie stracili.
Prolog „Whispers of Oblivion” 16 czerwca 2015 roku podczas targów E3 2015 Blizzard ogłosił wydanie prologu kampanii Legacy of the Void, zatytułowanego "Whispers of Oblivion" (pl. "Szepty o zagładzie"). Jest on pomostem pomiędzy wydarzeniami z Heart of the Swarm a drugim dodatkiem oraz składa się z 3 misji wprowadzających do fabuły LotV, oscylujących wokół Mrocznego Prałata Zeratula, chcącego odkryć ostatni element proroctwa xel'naga.