Służba Dowódcą okrętu został 18 stycznia 1916 roku mianowany Oberleutnant zur See Herbert Pustkuchen(28 grudnia 1889 – 12 czerwca 1917), pierwszy dowódca UB-29, Wcześniej dowódca SM UC-5 następnie SM UC-66. Pod jego dowództwem trzy okręty zatopiły 82 statki nieprzyjaciela o łącznej pojemności BRT, uszkodziły 3 statki nieprzyjaciela o łącznej pojemności BRT. Zatopiły także 12 okrętów nieprzyjaciela o łącznej wyporności ton. Herbert Pustkuchen zginął na pokładzie UC-66, 17 czerwca 1917 wraz z 23 członkami załogi.. Pustkuchen dowodził okrętem do 2 listopada 1916 roku. 8 marca jednostka został przydzielona do Flotylli treningowej i operowała w obszarze kanału La Manche, północnych wybrzeży Francji oraz Morza Celtyckiego.
250px|thumb| SS „Sussex” w porcie Boulogne-sur-Mer, po ataku przez UB-29. Pierwszym zatopionym przez UB-29 statkiem był należący do Soc. Anon. des Chargeurs de l’Ouest, Nantes, zbudowany w 1913 roku francuski parowiec o pojemności „Nominoe” ( BRT). 19 marca stojący na redzie koło Lowestoft statek został storpedowany i zatonął. W czasie tego samego patrolu UB-29 zatopił jeszcze 3 statki: 20 marca norweski „Langeli” ( BRT) oraz duński „Skodsborg” ( BRT), a 24 marca brytyjski „Salybia” ( BRT).