Holstein Kiel wygrał swoje mecze barażowe i awansował do 3. Ligi 2013/14. VfB Lübeck spadł do Oberligi 2013/14. FC Oberneuland spadł do Landesligi 2013/14 (nie otrzymał licencji na grę w Oberlidze 2013/14 i w następnym sezonie będzie występował w Landeslidze Bremen – szósty poziom rozgrywek), gdzie zajmie miejsce drużyny rezerw. Za wykroczenia licencyjne SV Wilhelmshaven został ukarany 6. punktami ujemnymi. VfB Lübeck (1 stycznia 2013) oraz FC Oberneuland (16 maja 2013) - w klubach ogłoszenie postępowania upadłościowego, a wyniki ich dotychczas rozegranych meczów zostały anulowane.
Nordost (Północny Wschód) Drużyny W Regionallidze w grupie północno-wschodniej w sezonie 2012/13 występowało 16 drużyn. Drużyna Miasto Sezon 2011/12 Uwagi Drużyna, która spadła z 3. Ligi 2011/12: FC Carl Zeiss Jena Jena 18 miejsce Drużyny, które występowały w Regionallidze Nord 2011/12: RB Leipzig Lipsk 3 miejsce Berliner AK 07 Berlin 7 miejsce ZFC Meuselwitz Meuselwitz 9 miejsce VFC Plauen Plauen 10 miejsce Hertha BSC II Berlin 14 miejsce Energie Cottbus II Chociebuż 15 miejsce VfB Germania Halberstadt Halberstadt 16 miejsce 1. FC Magdeburg Magdeburg 18 miejsce Drużyny, które awansowały z Oberligi 2011/12: FSV Zwickau Zwickau 1 miejsce OL Nordost-Süd VfB Auerbach Auerbach/Vogtl. 2 miejsce OL Nordost-Süd 1.