W 1939 uciekł z niewoli niemieckiej i został aresztowany przez Sowietów za próbę przekroczenia granicy, gdy wracał do Lwowa. Zasłano go do obozu w Obwodzie Archangielskim. Po amnestionowaniu we wrześniu 1941 został odesłany do Tatiszczewa koło Saratowa i wcielony do 5.DP Armii Polskiej w ZSRR, w której służył do kwietnia 1942. Zwolniony ze służby z powody choroby. Do lipca 1944 był dyrektorem ochronki i szkoły polskiej w Mizbarze w Uzbekistanie.
Zmobilizowany do LWP 15 lub 16 sierpnia 1944. Od 23 września 1944 do 11 marca 1945 zastępca szefa Wojskowego Sądu Garnizonowego w Białymstoku. W tym czasie skazał na śmierć jedną osobę. 2 listopada 1944 awansowany na kpt WP. Od 12 marca do 31 grudnia 1945 sędzia i wiceprezes Wojskowego Sądu Okręgowego nr V w Krakowie oraz syndyk DOW nr V w Krakowie. 9 maja 1946 awansowany na podpułkownika WP.
26 listopada 1945 zmienił imię z Natan na Antoni.