W 2010 roku Instytut Geografii zmienił nazwę na Instytut Geografii i Studiów RegionalnychHistoria IF AP w Słupsku [on-line] [dostęp: 20.01.2014] [on-line] [dostęp: 20.01.2014]. Najmłodszą jednostką organizacyjną na wydziale był działający w latach 2002-2017 Instytut Nauk o Zdrowiu (w latach 2002-2012 jako Katedra Nauk o Zdrowiu, w latach 2012-2017 jako Instytut). Od 25 września 2017 do 30 września 2019 funkcjonował jako samodzielny Wydział.
Przełomowym wydarzeniem w dziejach Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego było nadanie mu przez Centralną Komisję do Spraw Stopni i Tytułów w roku akademickim 1999/2000 prawa do nadawania stopnia naukowego doktora nauk biologicznych w zakresie biologii [on-line] [dostęp: 20.01.2014].
Władze Wydziału W kadencji 2016-2019: Stanowisko Imię i nazwiskoDziekan dr hab. Andrzej IchaProdziekan ds. kształcenia i studentów dr hab. inż. Anna JarosiewiczProdziekan ds. nauki i współpracy z gospodarką dr hab. Dariusz Ficek
Poczet dziekanów 1999-2005: prof. dr hab. Eugeniusz Rydz – geograf (geografia społeczno-ekonomiczna) 2005-2012: prof. dr hab. Jan Trojanowski - biolog (ochrona środowiska) 2012-2019: dr hab.