W czerwcu 2000 roku katedra ta została zlikwidowana, a w jej miejsce w strukturze Instytutu Pedagogiki powołano do życia dwa zakłady: Zakład Sztuki Muzycznej (kierownik - prof. Leszek Kułakowski) oraz Zakład Edukacji Artystyczno-Estetycznej (kierownik - dr Jarosław Chaciński). Struktura ta przetrwała do 2002 roku, kiedy to postanowiono przywrócić samodzielną jednostkę organizacyjną pod nazwą Katedry Sztuki Muzycznej (kierownik - prof. Leszek Kułakowski). 26 stycznia 2005 w miejsce Katedry Sztuki Muzycznej powołano Instytut Muzyki. Od 1 października 2019 roku, zarządzeniem Rektora AP, Instytut funkcjonuje jako Katedra Sztuki Muzycznej Akademii Pomorskiej w Słupsku.
Władze Katedry W kadencji 2024–2028: Stanowisko Imię i nazwiskoKierownik dr hab. Jarosław ChacińskiZastępca Kierownika mgr Dorota GieruszczakDyrektor artystyczny dr hab. Monika Zytke
Kierunki kształcenia Katedra Sztuki Muzycznej kształci studentów na studiach licencjackich (3 letnie), po których ukończeniu ich absolwenci uzyskują tytuł zawodowy licencjata. Następnie mogą oni kontynuować dalszą edukację w ramach studiów magisterskich uzupełniających, trwających 2 lata i kończących się uzyskaniem tytułu zawodowego magistra.