Pdelay_Resp w trybie dwukrokowym Announce ogólny ogłaszanie właściwości zegara dla potrzeb BMCA Management ogólny zarządzanie konfiguracją i monitorowanie zegarów PTP Signaling ogólny negocjacja parametrów pracy między zegarami
PTP może być przenoszony przez UDP/IPv4, UDP/IPv6 albo bezpośrednio w warstwie 2 IEEE 802.3 Ethernet. Standard dopuszcza transmisję multicast, unicast oraz konfiguracje mieszane. W typowym mapowaniu UDP komunikaty zdarzeniowe używają portu 319/UDP, a komunikaty ogólne portu 320/UDP. W sieciach Ethernet ruch PTP bywa dodatkowo oznaczany priorytetem w VLAN, aby ograniczać wpływ kolejek i przeciążenia na komunikaty czasu.
Profile i zastosowania Standard IEEE 1588 definiuje mechanizmy ogólne, natomiast szczegółowe parametry pracy często ustalane są przez profile dostosowane do konkretnej branży. Profile określają m.in. tryb opóźnienia, częstotliwość komunikatów, zakres dopuszczalnych opcji, sposób wyboru transportu oraz wymagania wobec dokładności i interoperacyjności. W rewizji z 2019 roku opisano także profil wysokiej dokładności, przeznaczony dla odpowiednio zaprojektowanych sieci, w których możliwy jest transfer czasu z dokładnością lepszą niż 1 ns. Dzięki temu PTP stosuje się m.in.