thumb|240px|Uczelniana wieża zegarowa w 1879 thumb|240px|Nowa biblioteka uniwersytecka
Uniwersytet Otago (ang. University of Otago, maor. Te Whare Wānanga o Otago) – nowozelandzka uczelnia publiczna z siedzibą w Dunedin, stolicy regionu Otago.
Historia Wraz z gorączką złota, która sprowadzała do Otago nowych osadników, powstało zapotrzebowanie na edukację w tym rejonie. W 1869 roku Rada Prowincji Otago zadecydowała o założeniu pierwszej w kraju uczelni wyższej. Po dwóch latach przygotowań, w budynku przy ulicy Princes Street, (który później przekształcił się w Giełdę Papierów Wartościowych w Dunedin) nauczanie w 1871 roku rozpoczęło zaledwie trzech profesorów i 81 studentów. Pierwszym kanclerzem Uczelni był Thomas Burns (1796-1871), kapłan i współzałożyciel Dunedin. Od 1870 do 1961 roku Uniwersytet Otago był podporządkowany Uniwersytetowi Nowej Zelandii. W 1879 wybudowano pierwszy budynek uniwersytecki w kampusie nad rzeką Leith w North Dunedin. Od 1961 roku Uniwersytet Otago jest w pełni niezależną od innych placówką oświatową.