W 2002 przystąpiono do prac nad powiększeniem i przebudową świątyni, gdyż jej pierwotne rozmiary okazały się niewystarczające. Podjęto również prace nad wzniesieniem nowej dzwonnicy. Budowlę przebudowano w stylu neoruskim. mały|lewo|Sobór od frontu Szczególną czcią otaczana jest w cerkwi kopia Kazańskiej Ikony Matki Bożej przekazana przez patriarchę moskiewskiego i całej Rusi Aleksego II. W świątyni przechowywane są również cząstki relikwii świętych Andrzeja Apostoła, Mikołaja, Pantelejmona, Aleksandra Newskiego, Jana Chryzostoma, metropolity moskiewskiego Filipa, Sawy Storożewskiego, Mikołaja Japońskiego, świętej Anastazji. W 2004 w świątyni wystawione były także relikwie świętych nowomęczennic wielkiej księżnej Elżbiety oraz riasofornej mniszki Barbary, przywiezionych z Jerozolimy i wystawianych w różnych cerkwiach Rosji.
W 2003 na terenie soboru umieszczono pomnik pamięci gubernatora obwodu sachalińskiego Igora Farchutdinowa, tragicznie zmarłego w wypadku śmigłowca.
9 lutego 2014 25-letni mężczyzna wszedł do soboru z bronią palną i zastrzelił dwie osoby