Przy wejściu do budynku wydziału historii znajduje się tzw. kamień jeleni. Jest to czerwono-brązowa płyta granitowa mająca ponad 2500 lat z antycznymi rzeźbami syberyjskimi po obu stronach jej powierzchni. Płyty tego rodzaju były zazwyczaj wznoszone przy grobach najbardziej bogatych i sławnych ówczesnych ludzi. Kamień Jeleni został przywieziony do Irkucka z obszaru na wschód od Bajkału pod koniec XIX w. Ma ponad 2 m wysokości i ponad 1 m szerokości. Kamień pokrywają rzeźby siedmiu jeleni o różnych rozmiarach i dwóch małych koni, oraz rzeźba broni używanej do polowań przez człowieka prymitywnego.
Sale muzealne są miniaturami życia Syberii od czasów prehistorycznych do współczesności. Obecnie muzeum posiada kolekcję archeologiczną mającą powyżej 300 tys. eksponatów, reprezentujących zabytki z okresu paleolitu do epoki żelaza (1 piętro). Są tu m.in. bardzo rzadkie, rzeźbione figury mające ponad 30 000 lat, jurty wykonane ze skór dzikich zwierząt, drewniane chaty, broń i narzędzia buriackich osadników czy portrety pierwszych odkrywców i badaczy Syberii. W muzeum znajduje się największa w Rosji kolekcja archeologiczna nefrytu. Są to ozdoby i narzędzia pracy z białego i zielonego nefrytu, służące jako część wyposażenia z grobów z epoki kamienia i brązu.