Organizacja Orła Białego (na skutek zdrady lub braku doświadczenia konspiracyjnego) została zinfiltrowana przez niemiecki aparat bezpieczeństwa – aresztowano ponad 400 osób (była to zapewne zaplanowana akcja eksterminacji miejscowej inteligencji).
Franciszek Tatkowski został aresztowany przez Gestapo 29 stycznia 1940 r. Więziony i okrutnie torturowany w czasie śledztwa (w Radomiu) wraz z innymi został zamordowany na Firleju 4 lipca 1940 r.
Rodzina Żona: Jadwiga z domu Kalamarz (ślub 2 sierpnia 1919 w Rzeszowie)Jadwiga Tatkowska (ur. 1 października 1899, zm. 22 marca 1971 w Karwodrzy). Pochowana na cmentarzu w Nowym Sączu. Za: .
Dzieci: Aleksandra Emilia Tatkowska (ur. 29 kwietnia 1920 roku w Rozłopach pow. Zamojski) – absolwentka Liceum Handlowego w Krakowie, działała w ruchu oporu (AK), aresztowana w 1944 przez gestapoAleksandra Magdziarz (z domu Tatkowska) zmarła 3 października 2000 w Limanowej, pochowana na cmentarzu w Nowym Sączu. Za: . Jerzy Eugeniusz Tatkowski (ur. 25 października 1922 roku w Warszawie, zginął 16 stycznia 1945 roku na ulicy Staszica podczas bombardowania lotniczego), działał w ruchu oporu ZHP-AK („Lord”), kolportował m.in. prasę konspiracyjnąPochowany na cmentarzu w Skarżysku-Kamiennej.