18 września 2016 została obrana do Dumy Państwowej Federacji Rosyjskiej (parlamentu) z listy wyborczej partii rządzącej «Jedinaja Rossija» („Zjednoczona Rosja”). Od 5 października 2016 przewodniczący komisji parlamentarnej ds. kontroli wiarygodności informacji o dochodach, o majątku i zobowiązaniach majątkowego charakteru posłów, zastępca przewodniczącego komitetu parlamentarnego ds. bezpieczeństwa i przeciwdziałania korupcji. Jednocześnie opuściła stanowisko prokuratora Krymu.
Głęboko religijna prawosławna, deklaruje swój wielki szacunek dla osoby ostatniego cara Rosji Mikołaja II. W lutym 2017 ostro skrytykowała film Aleksieja Uczitiela Matylda opowiadający o romansie Mikołaja II z Matyldą Krzesińską, stwierdzając, że oczernia on kanonizowanego przez Rosyjski Kościół Prawosławny męczennika za wiarę. Pokłonska zamówiła u grupy profesorów ekspertyzę, w której konkluzji uznano film za obrazoburczy, świętokradczy i bliski pornografii. Następnie złożyła doniesienie do prokuratury, domagając się zakazu premiery filmu.
W kwietniu 2022 Pokłonska wyraziła sprzeciw wobec inwazji Rosji na Ukrainę krytykując jednocześnie symbol Z wykorzystywany przez rosyjskie siły wojskowe.