Organizacja i wyposażenie 21 ksap były takie same, jak dywizyjnej kompanii saperów.
Organizacja batalionu Dowództwo 20 batalionu saperów 21 kompania saperów 91 kompania saperów drogowych 92 kompania saperów drogowych 93 kompania saperów drogowych 20 pluton elektromechaniczny czołówka naprawcza 20 baonu saperów pluton łączności 20 baonu saperówPluton Łączności 20 Batalionu Saperów był pododdziałem przydzielonym.
Obsada oficerska 20 baonu saperów Stan z dnia 18 lipca 1946 roku z uwzględnieniem oficerów, którzy odeszli przed 18 lipca 1946 roku.
Dowództwo baonu dowódca baonu - mjr inż. Hipolit Marian Smoczkiewicz (od 5 VI 1945) p.o. zastępcy dowódcy baonu - mjr Eugeniusz Szubert (od 12 XII 1945) adiutant - kpt. Edward Mitko (od 5 VI 1945)
21 kompania saperów dowódca kompanii - kpt. Józef Buła (od VI 1945) zastępca dowódcy - por. Władysław Wojnarski (od VI 1945) dowódca I plutonu - por. Stefan Kozera (od 12 XII 1945)
91 kompania saperów drogowych dowódca kompanii - kpt. inż. Jan Czajkowski (do XII 1945) dowódca kompanii - kpt. inż. Aleksander Konarzewski (od 24 XII 1945) zastępca dowódcy kompanii - por. Stefan Librowski (od 21 IX 1945)
92 kompania saperów drogowych dowódca kompanii - por. Henryk Woźnicki (do IV 1946) zastępca dowódcy kompanii - por.