Znaczną część protestantów w Indiach stanowią baptyści. Pierwsi misjonarze baptystyczni dotarli do północno-wschodnich Indii w 1836 roku. Początkowo ewangelizacja polegała na edukacji i rozpowszechnianiu fragmentów Pisma Świętego poprzez wykorzystanie prasy drukarskiej pośród ludów Shan i Khamti. W 1984 roku stowarzyszenie baptystyczne CBCNEI obejmowało 400.000 ochrzczonych członków w 3627 kościołach. W 2011 roku CBCNEI składa się z sześciu konwencji członkowskich: Konwencja Baptystów Assam, Rada Kościołów Baptystów Arunachal, Konwencja Baptystów Garo, Konwencja Baptystów Karbi Anglong, Konwencja Baptystów Manipur i Rada Kościołów Baptystów Nagaland. Obejmują one rodzinę baptystyczną, z 94 stowarzyszeń w 7804 kościołach i 1.045.455 ochrzczonych członków.
Obecnie Nieoficjalnie mówi się, że chrześcijanie to już 6,5% populacji. Rozwija się szeroko ruch kościołów domowych, szczególnie w Indiach Północnych. Religijni, przeciwni chrześcijaństwu fanatycy wciąż są wielkim zagrożeniem w niektórych regionach.
Statystyki Ważniejsze kościoły w kraju, w 2010 roku, według Operation World: