1 października 1971 WOP został podporządkowany pod względem operacyjnym, a od 1 stycznia 1972 pod względem gospodarczym MSW. Do WOP powrócił cały pion kontroli ruchu granicznego wraz z przejściami. Przywrócono jednolity system ochrony granicy państwowej. Od 1 sierpnia 1972 GPK w Porcie Gdynia podlegała bezpośrednio pod sztab 16 Kaszubskiej Brygady WOP w Gdańsku (W 1976 zniesiona została numeracja brygad WOP i przyjęto tylko nazwę „regionalną” Kaszubska Brygada Wojsk Ochrony Pogranicza), tak funkcjonowała do 15 maja 1991.
Straż Graniczna: Po rozwiązaniu Wojsk Ochrony Pogranicza, 16 maja 1991 Graniczna Placówka Kontrolna Gdynia weszła w podporządkowanie Kaszubskiego Oddziału Straży Granicznej w GdańskuZarządzenie nr 021 Komendanta Głównego Straży Granicznej z 7.05.1991, utworzono Kaszubski Oddział SG. i przyjęła nazwę Graniczna Placówka Kontrolna Straży Granicznej w Gdyni.
W wyniku zmian nadmorskich struktur Straży Granicznej i rozformowaniu Kaszubskiego Oddziału Straży Granicznej, 2 czerwca 1992 Graniczna Placówka Kontrolna Straży Granicznej w Gdyni została włączona struktury Morskiego Oddziału Straży Granicznej.