Po opuszczeniu listopadowych meczów kadry powrócił do niej na Puchar Sześciu Narodów 2006.
Wybrany do składu na Puchar Świata 2007 wystąpił we wszystkich czterech meczach, a jego zespół niespodziewanie zakończył swój udział w turnieju na fazie grupowej. W listopadzie tego roku po raz pierwszy został kapitanem narodowej reprezentacji, sto dwudziestym piątym w historii, gdy poprowadził Walijczyków w meczu ze Springboks. Po objęciu funkcji selekcjonera przez Warrena Gatlanda Jenkins został relegowany na ławkę rezerwowych, jednak po dwóch meczach powrócił do wyjściowego składu, a niepowodzenie na Pucharze Świata reprezentacja Walii powetowała sobie w Pucharze Sześciu Narodów 2008, zwyciężając w tych zawodach i zdobywając kolejnego Wielkiego Szlema. W czerwcu tego roku pobił rekord Garina Jenkinsa w liczbie występów w kadrze zawodnika z pierwszej linii młyna.