W 1990 roku staraniem OSM wybudowano w Kolę oczyszczalnię ścieków, rozbudowano także bazę transportową. Jednocześnie zmniejszono zatrudnienie, zwalniając wielu pracowników punktów sklepów mleka. 30 marca 1990 roku przewodniczącym Rady Nadzorczej został Czesław Cieślak, który dwa lata później objął także funkcję prezesa spółdzielni. Do końca 1993 roku trwał dla spółdzielni trudny okres finansowy, co doprowadziło do znacznego zredukowania etatów, zawieszenia premii oraz wprowadzenia opłat za korzystanie z zakładowej stołówki.
W 1995 roku uruchomiono linię produkcyjną serka wiejskiego, następnie otwarto także linię ultrafiltracji serwatki. 9 lipca 2000 roku przejęto spółdzielnię w Ostrzeszowie. W 2006 roku OSM w Kole przejęło spółdzielnię w Kępnie, a w 2007 roku spółdzielnię w Grodkowie. W 2019 roku wykupiono spółdzielnię w Ostrowie Wielkopolskim, a rok później w Koninie.
thumb|Tramwaj MPK Wrocław z reklamą OSM w Kole (2005) W marcu 2021 roku przed siedzibą OSM odbył się protest dostawców mleka przeciwko obniżeniu ceny skupu tego surowca.