Jan Karnkowski herbu Junosza (ur. ok. 1520/1525, zm. po 4 kwietnia 1616 rokuPosłowie ziemscy koronni 1493-1600, pod red. Ireny Kaniewskiej, Warszawa 2013, s. 313.) – kasztelan lądzki.
Rodzina Pochodził z rodziny szlacheckiej herbu Junosza. Syn Tadeusza i Elżbiety Olszewskiej z Kanigowa. Miał 3 braci: Stanisława (1520-1603), arcybiskupa gnieźnieńskiego, Dadźboga i Piotra (zm. 1604), podkomorzego płockiego i starostę bobrownickiego.
Dwukrotnie żonaty: Pierwsza żona Dorota Moszczeńska urodziła syna Marcina (1554-1631), księdza. Druga żona Jadwiga Smogulecka z Nadborowa urodziła 10 dzieci: Stanisława (1566–1646), dworzanina, kasztelana dobrzyńskiego Andrzeja, kasztelana kowalskiego, czterokrotnie żonatego, m.in. z Elżbietą Działyńską, córką Stanisława, kasztelana elbląskiego, wojewody malborskiego i chełmińskiego. Jana, właściciela dóbr Nadborów Erazma (zm. 1634), podkomorzego łęczyckiego, kasztelana rypińskiego Annę (zm.