Dokładna natura zjawiska, która spowodowało rozbłysk, nie jest znana; powstało na ten temat kilka hipotez: rozerwanie gwiazdy, najprawdopodobniej białego karła przez supermasywną czarną dziurę, gwałtowne zapadnięcie dysku akrecyjnego powstałego wokół gwiazdowej czarnej dziury, nietypowa supernowa powstała z błękitnego nadolbrzyma wybuch supernowej w warunkach małej gęstości materii międzygwiazdowej. Według hipotezy o błękitnym nadolbrzymie, nietypowy rozbłysk został spowodowany przez bardzo długo zapadającą się gwiazdę w procesie powstawania supernowej. Po zapadnięciu jądra gwiazdy, co wytworzyło czarną dziurę, zewnętrzne, bardzo oddalone warstwy gwiazdy potrzebowały aż dwóch godzin, aby zostać przez nią wchłonięte i w trakcie zapadania się generowały promieniowanie gamma. Najbardziej niezwykłą cechą GRB 130925A były wielokrotnie powtarzające się gwałtowne rozbłyski rentgenowskie. Według tej hipotezy powodowane były przez dżety emitowane przez czarną dziurę, które z kolei rozgrzewały stosunkowo chłodną materię ją otaczającą.