Kościół świętego Andrzeja Apostoła w Prabutach – rzymskokatolicki kościół parafialny znajdujący się w mieście Prabuty, w województwie pomorskim. Należy do parafii św. Wojciecha w Prabutach, która to należy do dekanatu Prabuty diecezji elbląskiej.
Historia i architektura mały|lewo|190px|Wejście do świątyni Świątynia została wzniesiona z cegły w latach 1876-1878 dla istniejącej od 1870 roku parafii katolickiej w mieście jako trzeci kościół w mieście (po ewangelickich kościołach: miejskim oraz tzw. Polskim). Wieża została zbudowana w 1903 roku. Wzniesiono ją na rzucie prostokąta, nakryta jest spiczastym hełmem. Budowla nosiła wcześniej wezwanie świętego Wojciecha, a także Najświętszego Serca Pana Jezusa. Kościół reprezentuje styl neogotycki. Składa się z nawy z zewnętrznymi przyporami oraz wielobocznego prezbiterium. Do wyposażenia świątyni należą zabytkowe organy oraz neogotyckie ołtarze.
Po II wojnie światowej jednym z pierwszych proboszczów w Prabutach był franciszkanin i jasnowidz Czesław Klimuszko, który rozpoczął remont tej świątyni.
Organy W 1878 roku, firma organmistrzowska Augusta Terletzkiego z Elbląga zbudował dla kościoła 12 głosowy instrument z mechaniczną trakturą i wiatrownicami zasuwowo-klapowymi. Najprawdopodobniej uległ zniszczeniu podczas działań wojennych.