Organem komitetu był przewodniczący, a także prezydium, w skład którego wchodził przewodniczący, jego zastępcy, sekretarz oraz członkowie.
Komitet Budownictwa, Urbanistyki i Architektury sprawował nadzór nad dwoma technicznymi instytutami naukowo-badawczymi: Instytutem Budownictwa Mieszkaniowego oraz Instytutem Urbanistyki i Architektury..
Aparatem wykonawczym komitetu i jego przewodniczącego był urząd Komitetu Budownictwa, Urbanistyki i Architektury posiadający rangę ministerstwa. Jego organizację określał niepublikowany statut nadawany przez Radę Ministrów.
Zniesienie komitetu Komitet Budownictwa, Urbanistyki i Architektury zakończył działalność 3 marca 1964 r. po wejściu w życie ustawy z 25 lutego 1964 r. zmieniającej organizację i zakres działania naczelnych organów administracji państwowej w dziedzinie budownictwa i planowania przestrzennego. Większość zadań zniesionego komitetu przeszła do zakresu działania Ministra Budownictwa i Przemysłu Materiałów Budowlanych, część spraw została przekazana Komisji Planowania przy Radzie Ministrów, a także Ministrowi Rolnictwa..