W 1750 wszedł w skład powołanej przez biskupa krakowskiego Andrzeja Załuskiego komisji do opracowywania reformy w zakresie nauczania matematyki. Przypkowski do końca życia pełnił funkcję profesora na Wydziale Filozoficznym rezygnując z kariery uniwersyteckiej na bardziej intratnym Wydziale Teologicznym, co w ówczesnym środowisku uniwersyteckim było odosobnionym przypadkiem.
Prawdopodobnie Przypkowski był twórcą zegara słonecznego z 1740 znajdującego się na kościele Mariackim w Krakowie.
Zmarł 12 stycznia 1758 i został pochowany w kościele św. Anny w Krakowie.
Zobacz też Przypkowscy herbu Radwan
Bibliografia W. Buczkowska, Rok Bogdan, Jan Józef Przypkowski, [w:] Polski Słownik Biograficzny, tom XXIX, Ossolineum 1986. J. Buła, Katalog kalendarzy polskich od XVI do XVIII wieku w zbiorach Biblioteki Czartoryskich, Kraków 1994. J. Dianni, Studium matematyki na Uniwersytecie Jagiellońskim do połowy XIX wieku, Kraków 1963. J. Dobrzyniecka, Drukarnie Uniwersytetu Jagiellońskiego 1674 – 1783, Zeszyty Naukowe UJ, Prace Hist., z. 53, Warszawa 1975. T. Przypkowski, Czasy saskie.