Rok później ekipy SEAT-a dwukrotnie stawały na trzecim stopniu podium – w Rajdzie Nowej Zelandii (Toni Gardemeister) oraz w Rajdzie Wielkiej Brytanii (Harri Rovanperä). W 2000 roku Didier Auriol ukończył Rajd Safari na trzeciej pozycji. Po sezonie 2000 SEAT wycofał się z Rajdowych Mistrzostw Świata WRC, jednak jeszcze w sezonie 2001 SEAT Cordoba WRC Evo3 startował w wybranych rajdach.
Wyścigi samochodów turystycznych W 2002 roku SEAT utworzył serię SEAT León Supercopa, a rok później zespół dołączył do stawki European Touring Car Championship z samochodem SEAT Toledo Cupra. Rickard Rydell w 2004 roku odniósł pierwsze zwycięstwo dla zespołu.
Po przekształceniu ETCC w World Touring Car Championship w 2005 roku zwycięstwa dla zespołu odnosili Jordi Gené, Rickard Rydell i Peter Terting. Rydell został sklasyfikowany na szóstej pozycji. Rok później Gabriele Tarquini by piąty w końcowej klasyfikacji kierowców. W sezonie 2007 Gabriele Tarquini i Jordi Gené odnieśli dla ekipy po jednym zwycięstwie. Jednak nie poprawiono wyniku z poprzedniego sezonu – Tarquini był ósmy, a Gené dziesiąty. W 2008 roku Gabriele Tarquini stawał na najwyższym stopniu podium trzykrotnie, co pozwoliło mu zdobyć tytuł wicemistrzowski. W sumie SEAT odniósł osiem zwycięstw i zdobył tytuł w klasyfikacji producentów.