Zamiast większości odwołanych pociągów EIP uruchomiono połączenia Express InterCity obsługiwane klasycznymi składami wagonowymi.
13 grudnia 2015, podczas corocznej zmiany rozkładu jazdy, wydłużono trasy części pociągów do: Bielska-Białej Głównej (wydłużenie połączenia do Katowic z dodatkowymi postojami w Tychach, Pszczynie i Czechowicach-Dziedzicach); Gliwic (wydłużenie połączenia do Katowic z dodatkowym postojem w Zabrzu); Rzeszowa Głównego (wydłużenie połączenia do Krakowa z dodatkowymi postojami w Krakowie Płaszowie, Tarnowie i Dębicy). Ponadto dla części połączeń wprowadzono dodatkowe postoje w Ciechanowie, Działdowie i Zawierciu.
13 marca 2016 część połączeń do Wrocławia została tymczasowo przekierowana z linii nr 4 na linię nr 1, co wiązało się z wydłużeniem czasu przejazdu oraz postojem na stacji Częstochowa zamiast Częstochowa Stradom. Powodem zmiany były prace remontowe na linii nr 4.
29 kwietnia 2016 po raz drugi rozszerzono siatkę połączeń i wprowadzono nowe połączenia do: Jeleniej Góry (wydłużenie połączenia do Wrocławia z dodatkowym postojem w Wałbrzychu Miasto); Kołobrzegu (wydłużenie połączenia do Gdyni z dodatkowymi postojami w Lęborku, Słupsku i Koszalinie).