Od 1945 r. do marca 1954 r. Edmund Malinowski był zarządcą cmentarza w Gdańsku Oliwie przy ul. Opackiej. Po osiągnięciu wieku emerytalnego w 1964 r. przeszedł na emeryturę. Po śmierci żony w 1978 r. schorowany przeniósł się do Państwowego Domu Rencistów w Gdyni-Redłowie, gdzie umarł 5 czerwca 1980 r. Został pochowany na cmentarzu Gdynia-Witomino, sektor 59, rząd 6, grób 2https://gdynia.grobonet.com/grobonet/start.php?id=detale&idg=173756&inni=0&cinki=1 [dostęp 2020-06-03].. mały|Grób Edmunda Malinowskiego na cmentarzu Witomińskim
Ordery i odznaczenia Odznaczenia ppor. Edmunda Malinowskiego: Krzyż Walecznych nr 4, nadany dnia 29. VIII 1944 r. Medal za Zwycięstwo nr 0975530, nadany dnia 8 V 1946 r. Odznaka Grunwaldzka nr.104568, nadana dnia 30 IX 1946 r. Medal za Warszawę nr 054719, nadany dnia 9 V 1947 r. Medal Zwycięstwa i Wolności nr 48828, nadany dnia 9 V 1947 r.
Upamiętnienie W 2024 powstał film dokumentalny „…W sercu, w ogniu, w ciszy. Historia Edmunda Malinowskiego – dowódcy Plutonu Głuchoniemych AK”.