Kościół świętego Franciszka z Asyżu w Gdańsku – zabytkowy rzymskokatolicki kościół parafialny znajdujący się na gdańskim osiedlu Emaus (dzielnica Siedlce). Należy do dekanatu Gdańsk-Siedlce archidiecezji gdańskiej.
Historia thumb|left|Wnętrze kościoła W 1892 roku został założony komitet budowy świątyni. W latach 1904–1906 został wzniesiony kościół (cegielnia w Kadynach) według projektu Augusta Menkena. W dniu 4 grudnia 1906 roku budowla została konsekrowana przez biskupa chełmińskiego Augustyna Rosentretera.
W 1942 roku zostały zarekwirowane przez władze niemieckie dwa najmniejsze dzwony. W 1945 roku, w czasie działań wojennych zostały zniszczone: wieża, zegar, dach, sklepienie, trzy ołtarze, witraże, organy o 32 głosach, część murów, instalacja grzewcza oraz kanalizacja burzowa. W latach 1946–1948 budowla została częściowo odbudowana i w dniu 28 marca 1948 roku została ponownie poświęcona przez administratora apostolskiego, księdza Andrzeja Wronkę. W latach 1965–1975 został przeprowadzony generalny remont dachu, instalacji grzewczej, kanalizacji burzowej, organów, zostały wprawione okna oraz zmieniono wystrój prezbiterium, czyli: główny ołtarz, tabernakulum, figurę Chrystusa, ambonę i chrzcielnicę.