W kolejnych latach klub zaczął wystawiać drużynę seniorską w rozgrywkach III ligi (zwanej także rozgrywkami o awans do II ligi) – na tym poziomie Wilki Morskie występowały co najmniej od sezonu 2007/2008. W sezonie 2008/2009 Wilki Morskie wycofały się w trakcie sezonu z tych rozgrywek. Powróciły do nich w kolejnym sezonie, gdzie w drużynie tej grał między innymi Tomasz Gielo.
W sezonie 2010/2011 klub zajął w tych rozgrywkach, rywalizując w strefie zachodniopomorskiej, 3. pozycję. Występował w nich także w sezonie 2011/2012, gdy wywalczył awans z rywalizacji strefowej do międzystrefowej, jednak w turnieju półfinałowym o awans do II ligi zajął 3. pozycję i nie awansował do dalszych rozgrywek. Mimo to w sezonie 2011/2012 Wilki Morskie wystąpiły w II lidze, gdzie w grupie A zajęły 10. pozycję. W kolejnym sezonie klub zwyciężył w rozgrywkach grupy A II ligi i awansował do I ligi.
Po awansie Wilki Morskie połączyły się z AZS-em Szczecin, tworząc wspólnie klub, który pozostał przy nazwie Wilki Morskie Szczecin. W sezonie 2013/2014 Wilki Morskie awansowały do fazy play-off I ligi, jednak w ćwierćfinale przegrały z klubem KKK MOSiR Krosno i odpadły z dalszej rywalizacji.