Wybuch w 1939 wojny uniemożliwił kontynuację działalności Seminarium. Dwie denominacje baptystyczne, na rzecz których działał przestały istnieć: Unia Zborów Baptystów Języka Niemieckiego w Polsce została wcielona do Związku Zborów Baptystów w Niemczech, a zbory członkowskie Związku Zborów Słowiańskich Baptystów stały się częścią Związku Nieniemieckich Ewangelicko-Wolnokościelnych Zborów.
Dyrektorzy 1907–1911 – Eugen Mohr (1868–1917) 1923–1932 – Friedrich Brauer (1854–1945) 1932–1939 – dr Hugo Lueck (ur. 1902)Kl243
Siedziba W początkowym okresie siedziba Seminarium mieściła się w budynkach I zboru baptystycznego w Łodzi przy ul. Nawrot 27, zajęcia odbywały się również w willi fabrykanta Adolfa Horaka w Łodzi. W 1928 zakupiono za 47 500 złotych nieruchomość w Łodzi przy ul. Lipowej 93.
Kontynuatorzy W Polsce Ludowej edukację duchownych baptystycznych zapewniało Seminarium Teologiczne Polskiego Kościoła Chrześcijan Baptystów, które ma następcę w postaci Wyższego Baptystycznego Seminarium Teologicznego w Warszawie.
Absolwenci Szymon Biliński Aleksander Kircun Kazimierz Najmałowski