Yōkō-ji pozostawał głównym klasztorem linii Gikaia w czasie życia Keizana i jego bezpośrednich uczniów. Po śmierci Keizana w 1325 roku opatem został Meihō Sotetsu, który piastował to stanowisko do momentu, gdy powtórnie przejął prowadzenie Daijō-ji przed 1339 rokiem. Po nim opatem został Mugai Chikō, następnie Gasan Jōseki i wreszcie Koan Shikan, czyli wszystko odbywało się tak jak pragnął Keizan. Gdy opatem był Mugai siogunat Ashikagów ufundował budowę trzykondygnacyjnej pagody. Patronat siogunatu świadczył o tym, że klasztor cieszył się wysokim statusem. Nowa pagoda przysporzyła jeszcze więcej dotacji i wzniesiono wtedy wiele nowych budynków w klasztorze, takich jak nowy budynek mnichów i łaźnię (1338), sieć korytarzy (1339) i wieżę dzwonu na brązowy dzwon (1342)William M. Bodiford. Sōtō Zen in Medieval Japan. Str. 100.