Rok później zaliczył swój trzeci występ meczu gwiazd, otrzymał też trzecią nominację do drugiego składu najlepszych zawodników NBA.
12 marca 1958 roku, podczas ostatniego spotkania sezonu 1957/58 (przeciw Lakers), miał miejsce tragiczny w skutkach wypadek. Stokes ścinając pod kosz przewrócił się i uderzył feralnie głową w parkiet, po czym stracił przytomność. W szatni podano mu sole trzeźwiące, po czym powrócił na boisko. Trzy dni później wystąpił w pierwszym spotkaniu fazy play-off przeciwko Detroit Pistons, notując 12 punktów oraz 15 zbiórek. W trakcie lotu powrotnego do Cincinnati poczuł się jednak bardzo źle. Kilka dni później został sparaliżowany i zapadł w śpiączkę, w konsekwencji wcześniejszego wypadku. Zdiagnozowano u niego encefalopatię, potocznie uszkodzenie mózgu.
Z pomocą przyszedł mu kolega z zespołu, z którym wspólnie rozpoczynał swoją karierę w NBA – Jack Twyman. To właśnie on organizował pieniądze na opiekę medyczną Stokesa oraz założył mającą mu w tym pomóc fundację jego imienia – Maurice Stokes Foundation. Organizował mecze pokazowe – Maurice Stokes Memorial Basketball Games, w celu zbiórki pieniędzy. Spotkania te zastąpił z biegiem lat turniej golfowy – Maurice Stokes/Wilt Chamberlain Celebrity Pro-Am Golf Tournament. Z czasem Twyman został prawnym opiekunem Stokesa.