Nabożeństwa prowadzone są w budynku kościoła należącego do zboru Czechosłowackiego Kościoła Husyckiego Brno-Královo Pole.
Organizacja Podstawową jednostką ECAV v ČR jest zbór na czele z prezydium, które tworzą proboszcz oraz kurator zboru. Najwyższym organem zborowym jest Zgromadzenie Parafialne, w którym mogą uczestniczyć wszyscy jego pełnoletni członkowie. W czasie pomiędzy zgromadzeniami, zborem zarządza prezbiterium, w skład którego wchodzą proboszcz, kurator oraz wybrani prezbiterzyEvangelická církev augsburského vyznání v České republice - Struktura a předastavitelé.
Najwyższym organem kościoła jest Synod, składający się z duchownych oraz świeckich delegatów. Kierownictwo kościoła stanowi superintendent oraz starszy konsystorz. Wewnętrzną kontrolę sprawuje komisja rewizyjna, wybierana przez Synod.
ECAV obecnie posiada pięć zborów: trzy w Pradze (słowacki, czeski i angielski), po jednym w Brnie i Pilźnie.
W celach informacyjnych wydaje dla swoich członków i sympatyków pismo "Evangelicus".
Wierni Według Spisu Powszechnego z 2011 roku do ECAV v ČR przynależało 6 632 wiernychSčítání lidu, domů a bytů 2011 v Česku.