W pierwszej połowie lat 90. XX wieku działalność Chem Trans Logistic była ściśle związana z przedsiębiorstwem . Drogi biznesowe Waldemara Preussnera i Jarosława Pawluka jednak rozeszły się. W drugiej połowie lat 90. XX wieku strategia CTL Logistics została skoncentrowana na towarowych przewozach kolejowych. Na przełomie XX i XXI wieku przedsiębiorstwo uczestniczyło w prywatyzacji zakładowych przedsiębiorstw kolejowych największych polskich kombinatów. Przejęła obsługę kilku dochodowych bocznic kolejowych w: Braniewie, Bydgoszczy, Gdyni, Kędzierzynie-Koźlu, Medyce, Policach, Puławach i Szczecinie.
Kluczowym momentem w działalności Jarosława Pawluka okazał się zakup sosnowieckiego przedsiębiorstwa KP Maczki-Bór. Spółka została nabyta w 2001 roku. Dysponowała ona stabilną i mocno ugruntowaną pozycją w obsłudze górnictwa i przemysłu na Górnym Śląsku i w Zagłębiu Dąbrowskim. Przede wszystkim jednak posiadała dużą ilość taboru, uzyskała licencję na przewozy kolejowe po liniach PKP PLK, a także miała zaplecze techniczne, własną infrastrukturę kolejową i doświadczoną kadrę pracowników.
W ciągu kilku lat holding CTL Logistics wyrósł na największego prywatnego, towarowego przewoźnika kolejowego w Polsce.