Losy po zakończeniu kariery W 1963 zakończył karierę, gdyż został powołany do wojska. W 1974 jako generał dywizji objął stanowisko ministra kultury i rozwoju społeczeństwa. Po odejściu z wojska został bankierem. Był również trenerem bokserskiej reprezentacji Ugandy na igrzyskach olimpijskich w 1968. W 1971 pełnił także funkcję prezesa Krajowej Rady Sportu podległej ministerstwu edukacji i sportu. W 1979 lub 1981 objął posadę prezesa ugandyjskiego komitetu olimpijskiego, którym był do 2009. Pełniąc tę funkcję został zamieszany w skandal związany z wyborem organizatora IO 2000. Za przyznanie igrzysk w 2000 Sydney miał otrzymać 35000$ oraz darmowe zakwaterowanie w Dorchester Hotel w Londynie. Nyangweso nie przyznał się do przyjęcia łapówki. W latach 1986–2006 był wiceprezesem AIBA, a w latach 1991-2001 pełnił funkcję prezesa Association of National Olympic Committees of Africa. W 1988 został wybrany członkiem MKOl.
Zmarł 15 lutego 2011 na niewydolność nerek oraz cukrzycę. Od 2010 jeździł na wózku inwalidzkim, po tym, jak amputowano mu nogę, a w ostatnich miesiącach życia był przykuty do łóżka.