Komendant Główny SG, Marek Bieńkowski, wydał Decyzję nr 34 z 5 sierpnia 1998 w sprawie powołania zespołów do spraw nadzoru nad likwidacją Beskidzkiego OSG oraz rodzajów czynności likwidacyjnych. Oddział został rozwiązany z końcem 1998, na podstawie Decyzji nr 277 MSWiA z 5 sierpnia 1998 w sprawie likwidacji Beskidzkiego OSG. Odcinek granicy państwowej został przejęty przez Karpacki Oddział Straży Granicznej w Nowym Sączu i Śląski Oddział Straży Granicznej w Raciborzu.
Zasięg terytorialny Beskidzki Oddział Straży Granicznej przejął do ochrony lądowy południowy odcinek granicy państwowej z Czechosłowacją o długości 164 km, Od Korbielowa, do Zebrzydowic.
Od 1 stycznia 1993 po rozpadzie Czechosłowacji, Beskidzki Oddział Straży Granicznej ochraniał odcinek granicy państwowej: Włącznie znak graniczny nr III/90, wyłącznie znak gran. nr III/348: Z Republiką Słowacką – 88 km Z Republiką Czeską – 76 km.
W terytorialnym zasięgu działania oddziału, terenowymi organami Straży Granicznej byli komendant oddziału, komendanci strażnic i granicznych placówek kontrolnych.