Działał w Polskim Towarzystwie Zootechnicznym: pełnił funkcję wiceprezesa (do 1948), a następnie prezesa.

W tym samym okresie należał do grona organizatorów Wydziału Rolniczego na nowym uniwersytecie, utworzonym w Lublinie – Uniwersytecie Marii Curie-Skłodowskiej (obecnie Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie). Na tym wydziale utworzył w roku 1945 Zakład Fizjologii i Żywienia Zwierząt, którym kierował przez 10 lat (do śmierci).

Publikacje Henryk Malarski opublikował 12 podręczników oraz liczne artykuły i referaty naukowe. W latach 1909–1913 w „Anzeiger der Akademie der Wissenschaften in Krakau” i „Biochemische Zeitschrift” ukazały się prace biochemiczne, wykonywane z udziałem Leona Marchlewskiego: 1909 – Studien in der Chlorophyllgrouppe. Über Zinkchlorophyleee und Zinkprophyllotaonine (praca doktorska) 1910 – Bestimmung des Chlorophylls in Pflanzenteilen 1912 – Anhydro-Phyllotaonine 1913 – Phyllocyanin und Phylloxantin Schunck's W latach dwudziestolecia międzywojennego H. Malarski opublikował m.in.: 1921, 1922, 1926 – rozprawy nt.