związku z rezygnacją z gry mistrza grupy II – Kani Gostyń. Polonia Bytom została ukarana trzema punktami ujemnymi za zaległości finansowe. Górnik Polkowice został zdegradowany do IV ligi za udział w aferze korupcyjnej. KSZO Ostrowiec Świętokrzyski został zdegradowany do III ligi za udział w aferze korupcyjnej (patrz: Kary degradacji nałożone przez PZPN). Kmita Zabierzów przegrał dwumecz barażowy, jednak w związku z brakiem licencji na grę w II lidze dla Pogoni Szczecin (spadkowicz z I ligi) pozostała na drugim poziomie rozgrywkowym. Patrz także II liga polska w piłce nożnej (2006/2007)
Mecze Mecze i wyniki Lp.DataRozgrywkiPrzeciwnikWynikStrzelcy bramek1 23.08.2006 Pruszcz Gd. PP - I run. 1500 W Czarni Pruszcz Gd. 1:5 Mateusz Cieluch 4' 52' 87' Konon 54' 59' awans2 30.07.2006 Ostrowiec Św. II Liga - 1 kol. 3000 W KSZO Ostrowiec Św. 0:2 Sobociński 83', Konon 90' 3 3 2:0 3 05.08.2006 Białystok II Liga - 2 kol. 4500 D Lechia Gdańsk 2:1 Chańko 64', Robert Speichler 84'(k) 1 6 4:1 4 11.08.2006 Gliwice II Liga - 3 kol. 4000 W Piast Gliwice 0:2 Chańko 30', Markiewicz 61' 1 9 6:15 19.08.2006 Białystok II Liga - 4 kol. 4000 D Podbeskidzie Bielsko-Biała 2:0 A.Napierała 65', P.Sobolewski 88' 1 12 8:16 26.08.2006 Legnica II Liga - 5 kol. 2500 W Miedź Legnica 1:1 Chańko 73' 1 13 9:27 30.08.2006 Polkowice II Liga - 6 kol.