W 2002 roku wstąpiła Australia, a następnie Peru, Turcja, Grecja, Japonia, Kanada oraz Chorwacja.
Organizacja nie posiada własnego Zarządu a jedynie honorowego prezydenta którym został James C.S. Blakely (Wielka Brytania). Kongresy organizowane są co roku (zwyczajowo koło maja) każdorazowo w innym kraju. Decyzję o miejscu (kraju) w którym będzie odbywać się kolejny kongres podejmuje Zebranie Przewodniczących Delegacji Narodowych w drodze głosowania w trakcie Kongresu na 3 lata do przodu potwierdzając to co roku.
Bractwo Okrętów Podwodnych po raz pierwszy zorganizowało 45. Międzynarodowy Kongres Podwodniaków w 2008 roku w Gdyni. Na Kongres przybyło ponad 300 delegatów z 13 krajów. Kolejny Kongres Bractwo planuje zorganizować w roku 2018 kiedy to 100-lecie powstania obchodzić będzie wspólnie polska Marynarka Wojenna oraz Liga Morska i Rzeczna.