6 grudnia 1998 roku ukazał się piąty album zespołu pt. Caravan Beyond Redemption. 18 stycznia 2000 roku nakładem wytwórni muzycznej Music Cartel ukazała się kompilacja In Memoriam. W lutym 2001 roku ukazał się szósty album zespołu pt. Endtyme. Album promował singel pt. Gargoylian. Oprawę graficzną płyty przygotował Stephen O'Malley. Tego samego roku ukazało się pierwsze DVD formacji zatytułowane Our God Has Landed. 21 października 2002 roku ukazał się siódmy album zespołu pt. The VIIth Coming. Płytę wydała wytwórnia Dream Catcher Records.
W styczniu 2003 roku Cathedral wraz z grupą Samael odbyli europejską trasę koncertową. Natomiast latem muzycy podpisali kontrakt z wytwórnią muzyczną Nuclear Blast. 21 czerwca 2004 roku nakładem wytwórni muzycznej Earache Records ukazała się dwupłytowa kompilacja pt. The Serpent's Gold. 26 września 2005 roku ukazał się ósmy album zespołu pt. The Garden of Unearthly Delights. W kwietniu 2009 roku zespół wystąpił na festiwalu Hammerfest wraz z takimi zespołami jak: Saxon, Opeth czy Paradise Lost. 26 marca 2010 roku ukazał się dziewiąty album zespołu pt. The Guessing Game. Płyta zadebiutowała na 31. miejscu greckiej listy sprzedaży.