Przebieg masakry Udział w najeździe wzięło przeszło kilkuset rebeliantów. Zajęte zostały nie tylko te miasta, ale i 16 wiosek w pobliżu miast oraz międzynarodowa baza wojskowa. Do ataku bojownicy wykorzystali karabiny szturmowe i granatniki przeciwpancerne, okazyjnie materiały wybuchowe.
Masakrę, która wydarzyła się w tych miastach, rozpoczęły przyjazdy ciężarówek i opancerzonych samochodów, w środku których znajdowała się pokaźna ilość amunicji. Z tych samych pojazdów oraz motocykli wysiedli bojownicy i od razu zaczęli strzelać do mieszkańców miast. Ludzie, obawiając się terrorystycznego rajdu na miasto, uciekali prosto do buszu, inni mieli zamiar uciekać do Czadu. W czasie ataku bojownicy zabijali ludzi (ofiary ginęły od ran postrzałowych) i podpalali mieszkania. Mieszkańcy zaatakowanego miasta chronili się także w domach. Rozwiązanie to było nieskuteczne, bojownicy uzbrojeni w granatniki podpalali mieszkania, w środku których byli przerażeni cywile.
Już w czasie samej masakry, wojskowi zaczęli ewakuować ludność z ciągle atakowanego miasta. Obawiano się, że Baga, jeżeli zostanie zdobyta przez bojówkarzy z Boko Haram, to może posłużyć jako baza wypadowa do ataku na kolejne pobliskie miasto Monguno.