Kariera reprezentacyjna Frank Loughran w latach 1955–1958 rozegrał 8 meczów w reprezentacji Australii, w której zadebiutował dnia 23 września 1955 roku na Brisbane Cricket Ground w Brisbane w przegranym 0:3 meczu towarzyskim przeciwko reprezentacji RPA. Brał z reprezentacją udział na igrzyskach olimpijskich 1956 w Melbourne, gdzie reprezentacja zakończyła udział w ćwierćfinale po przegranej 2:4 z reprezentacją Indii, a Loughran dnia 27 listopada 1956 roku strzelił swoją pierwszą bramkę dla reprezentacji w wygranym 2:0 meczu z reprezentacją Japonii. Swoją ostatnią bramkę dla reprezentacji strzelił dnia 16 sierpnia 1958 roku na Basin Reserve w Wellington w wygranym 3:2 meczu z reprezentacją Nowej Zelandii, przeciwko której dnia 23 sierpnia 1958 roku na Carlaw Park w Aucklandzie rozegrał swój ostatni mecz w reprezentacji, który zakończył się remisem 2:2.
Grał również w reprezentacji Australii B, w której rozegrał ponad 30 meczów i strzelił 22 gole, w której ostatni mecz rozegrał dnia 16 maja 1959 w przegranym 1:7 meczu przeciwko Heart of Midlothian w ramach tournée tego klubuSocceroo B Matches for 1959 .
Loughran za swój wkład w australijskiej piłce nożnej został wprowadzony do Australian Football (Soccer) Hall of Fame w lutym 1999 roku oraz odznaczony Medalem Doskonałości.