Puchar Świata juniorów w łyżwiarstwie szybkim 2012/2013 był piątą edycją tej imprezy. Cykl rozpoczął się w Calgary 15 listopada 2012 roku, a zakończył 17 lutego 2014 w Klobenstein.
Puchar Świata rozegrany został w 7 miastach, w 6 krajach, na 3 kontynentach. Zawody w Astanie zostały odwołane.
Medaliści zawodów Kobiety Lp.DataMiejscowośćKonkurencja1 miejsce2 miejsce3 miejsce 1. PŚJ 15–16 listopada 2012 Calgary 500 m (15.11) Kate Hanly Kako Yamane Konami Soga 1000 m (15.11) Kate Hanly Saori Toi Kako Yamane 3000 m (16.11) Nene Sakai Saori Toi Josie Spence 500 m (16.11) Kako Yamane Kate Hanly Konami Soga 1500 m (16.11) Natsumi Takayama Saori Toi Josie Spence Start masowy (16.11) Nene Sakai Josie Spence Natsumi Takayama 2. PŚJ 17–18 grudnia 2012 Mińsk 500 m (17.12) Vanessa Bittner Doreen Lamb Bente van den Berge 1000 m (17.12) Vanessa Bittner Reina Anema Doreen Lamb 3000 m (17.12) Reina Anema Jade van der Molen Leia Behlau 500 m (18.12) Vanessa Bittner Doreen Lamb Bente van den Berge 1500 m (18.12) Reina Anema Jade van der Molen Ineke Dedden Start masowy (18.12) Ineke Dedden Jade van der Molen Reina Anema 3.